A Política da Qualidade da FMH rege-se pelos seguintes princípios na procura da excelência:
Aumentar a motivação e elevar o desempenho na gestão por meio de uma abordagem participativa e colaborativa;
Utilizar as tecnologias de informação (TI) para imprimir rapidez nas respostas a stakeholders internos e externos;
Ser eficiente e eficaz na concretização dos objetivos;
Satisfazer os requisitos legais e os requisitos do serviço a prestar aos stakeholders;
Contribuir para a melhoria da qualidade de vida dos cidadãos;
Melhorar os serviços e as tarefas de forma consistente de acordo com o sistema de gestão da qualidade;
Garantir a segurança da informação e a proteção dos dados pessoais, salvaguardando os direitos e deveres definidos pela legislação em vigor;
Apoiar e sustentar todos os níveis de decisão e regulação de funcionamento em todas as estruturas da FMH.